Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms