Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp37Q8C0R0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms