Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zhx3Q8C0Q2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms