Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FarsaQ8C0C7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms