Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms