Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tnfsfm13Q8BXS2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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