Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam53cQ8BXQ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fam53cQ8BXQ8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fam53cQ8BXQ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fam53cQ8BXQ8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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