Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep55Q8BT07 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms