Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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