Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timm29Q8BGX2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms