Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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