Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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