Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt12Q8BG71 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms