Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms