Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Liat1Q810M6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms