Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Smim19Q80ZU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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