Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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