Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrde2Q80XC6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms