Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmcc2Q80W04 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms