Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AknaQ80VW7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AknaQ80VW7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms