Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms