Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms