Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms