Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms