Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms