Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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