Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms