Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snd1Q78PY7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms