Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms