Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Atp8b3Q6UQ17 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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