Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms