Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms