Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms