Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms