Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrimpolQ6P1E7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms