Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slx4Q6P1D7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms