Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23ipQ6NZC7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23ipQ6NZC7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23ipQ6NZC7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23ipQ6NZC7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23ipQ6NZC7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23ipQ6NZC7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms