Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd2Q6NXI6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms