Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms