Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms