Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms