Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l2Q6KAU8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms