Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms