Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms