Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw2Q6I6G8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms