Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms