Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca2Q6DIC0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms