Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms