Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Msl2Q69ZF8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Msl2Q69ZF8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Msl2Q69ZF8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms