Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms